В большинстве случаев организация, имеющая право на льготные тарифы взносов, вправе их применять в отношении выплат сотрудникам как головного офиса, так и обособленных подразделений.

Источник: Письмо Минфина России от 03.04.2019 N 03-15-07/23207 (направлено письмом ФНС от 30.05.2019 N БС-4-11/10445@)

Дело в том, что плательщиками страховых взносов признаются организации, т.е. юрлица. Представительства и филиалы не являются юрлицами, следовательно, обособленные подразделения не признаются самостоятельными плательщиками взносов. Это значит, что если организация относится к категории плательщиков взносов, которой разрешено применять пониженные тарифы, эта льгота распространяется на выплаты всем работникам компании, в т.ч. тем, кто трудится в обособках.

Впрочем, из этого правила есть исключение. Так, льготные тарифы, установленные для организаций, которые расположены в особых экономических зонах (пп. 11 – 14 п.1 ст. 427 НК) могут применяться в отношении выплат только тем работникам, которые работают в пределах соответствующих территорий. Соответственно, если обособка компании находится за пределами особой экономической зоны, выплаты в пользу ее работников облагаются взносами по общеустановленным тарифам.