Упрощенец обязан включать в УСН-базу сумму полученного от контрагента гарантийного платежа, только если точно не собирается ее возвращать.

Источник: п.10 Обзора судебной практики (утв. Президиумом Верховного Суда РФ 04.07.2018)

Например, условиями договора аренды предусмотрено, что полученный арендодателем-упрощенцем гарантийный платеж «пойдет в дело» лишь в крайнем случае (в частности, при причинении убытков имуществу арендодателя), а по умолчанию подлежит возврату по окончании действия договора. Тогда сумму такого гарантийного платежа учитывать в базе по упрощенному налогу не требуется.

А вот если договором установлено, что гарантийный платеж возвращать арендатору не нужно, поскольку он пойдет в зачет арендной платы за последний месяц аренды, то такая сумма считается полученным арендодателем авансом и должна быть включена в состав УСН-доходов.