Дистанционный работник, который сам решает, когда ему работать, а когда отдыхать, не может претендовать на повышенную оплату или отгул за работу в выходной.

Источник: Обзор актуальных вопросов от работников и работодателей за май 2018 года

По общему правилу работа в выходной или нерабочий праздничный день оплачивается в повышенном (не менее чем в двойном) размере. По желанию работника двойная оплата может быть заменена предоставлением другого дня отдыха. Какого-то специального порядка предоставления дней отдыха за работу в выходные дни для дистанционных работников не предусмотрено.

При этом согласно ТК, режим рабочего времени и времени отдыха дистанционного работника устанавливается им по своему усмотрению. Если, конечно, в трудовом договоре не прописаны иные условия (ст. 312.4 ТК РФ).

Соответственно, при таком свободном графике, определить, какой день у дистанционного сотрудника рабочий, а какой выходной, просто невозможно. А значит, работу дистанционщика в какой-либо определенный день нельзя считать работой в выходной.