В случае, когда ИП прекратил «патентную» деятельность до истечения срока действия патента, стоимость патента пересчитывается пропорционально фактически отработанным на патенте календарным дням.

Источник: Письмо Минфина от 27.04.2018 № 03-11-12/28952

В данной ситуации налоговым периодом для ИП будет признаваться период с начала действия патента до даты прекращения деятельности, указанной в заявлении об утрате права на применение ПСН.

Если ИП уже оплатил всю стоимость патента, то при пересчете налога исходя из фактического времени ведения «патентной» деятельности, у него образуется переплата. Излишек можно вернуть или зачесть в счет уплаты других налогов. Зачет/возврат производится налоговиками на основании поданного ИП заявления.

Если же при пересчете стоимости патента образуется сумма налога к доплате, перечислить недостающую сумму ИП должен не позднее срока, указанного в патенте.