Порядок начисления НДФЛ с сумм, выплаченных сотруднику за время работы за пределами РФ, зависит от нескольких факторов. А именно, от резидентского статуса физлица-получателя дохода, а также от того, на каком основании он трудится за границей (постоянное «зарубежное» место работы или загранкомандировка).

Источник: Письмо Минфина от 26.03.2018 № 03-04-05/18898

Если в трудовом договоре с сотрудником прописано, что место его работы находится за пределами РФ, выплаты, получаемые сотрудником по такому договору, в НДФЛ-целях считаются доходами, полученными от источников за пределами РФ. Это означает, что если такой сотрудник признается налоговым резидентом РФ, то НДФЛ с его зарплаты исчисляется в общеустановленном порядке. А если сотрудник утратил резидентский статус (т.е. находился в РФ менее 183 календарных дней в течение следующих подряд 12 месяцев), начисляемые ему выплаты НДФЛ не облагаются.

А вот в ситуации, когда рабочее место сотрудника находится в России, а за границу он поехал в командировку, НДФЛ с выплат в его пользу нужно будет начислять всегда, то есть независимо от резидентства. Дело в том, что на время нахождения работника в служебной командировке за пределами РФ за ним сохраняется средний заработок. И как указывает Минифин выплата среднего заработка, не считается вознаграждением за выполнение трудовых обязанностей и относится к доходам, полученным от российских источников. Соответственно, в этой ситуации от резидентского статуса командированного работника зависит только ставка НДФЛ. До тех пор пока работник не утратил статус резидента РФ, выплачиваемые ему суммы облагаются налогом по ставке 13%, а после того как он стал нерезидентом – 30%.