Сотрудники ИФНС могут, но не обязаны учитывать уточненные декларации, которые налогоплательщик сдал после окончания проверки, но до вынесения решения по ней.

Источник: Информация ФНС; Определение ВС РФ от 12.12.2017 № 301-КГ17-14742

Так, в рассмотренном Верховным судом деле компания сдала уточненку в день составления справки о проведенной проверке, указав в ней сумму налога к доплате равную той, что доначислили инспекторы по итогам проверки. Эту уточненку налоговики при вынесения решения по проверке не учли.

Компания обратилась в суд, но судьи встали на сторону инспекции. Как следует из вынесенного вердикта, поскольку в НК нет критериев проверки уточненок, представленных после окончания выездной проверки, но до вынесения по ней решения, сотрудники ИФНС вправе самостоятельно определять в рамках каких мероприятий налогового контроля будут их проверять. Это могут быть допмероприятия, камеральная или повторная выездная проверка. Помимо этого, подачей уточненной декларации компания фактически признала правомерность доначислений по результатам проверки. К тому же, сдав уточненную декларацию, заявленный в ней НДС фирма в бюджет не перечислила. На основании этого штрафные санкции, наложенные на компанию по итогам проверки, суды оставили в силе.